目前，在干細(xì)胞的基礎(chǔ)研究和臨床治療研究中，首要來(lái)源是自體干細(xì)胞。其次是異體干細(xì)胞，此外，還有經(jīng)過(guò)特殊培養(yǎng)的動(dòng)物來(lái)源的干細(xì)胞等。所謂干細(xì)胞的內(nèi)源性污染，著重強(qiáng)調(diào)的是細(xì)胞自身所攜帶傳染性疾病以及遺傳性疾病的問(wèn)題。內(nèi)源性污染的途徑及可能的危害。細(xì)胞自身所攜帶傳染性疾病在細(xì)胞的使用過(guò)程中，傳染性疾病的傳播是一個(gè)大家普遍關(guān)心的問(wèn)題，其風(fēng)險(xiǎn)程度和可能的傳播后果，會(huì)隨著細(xì)胞的來(lái)源、操作或培養(yǎng)方法以及是否采取適當(dāng)?shù)目刂拼胧┒胁煌?。例如，使用異體細(xì)胞而非自體細(xì)胞，可增加傳播傳染病的風(fēng)險(xiǎn)，因?yàn)楣w可能攜帶有受體易感的傳染病病原體。而即便是自體細(xì)胞,如果被HCMV等病毒所潛伏感染，體外培養(yǎng)過(guò)程中，適宜條件下病毒可能迅速?gòu)?fù)制擴(kuò)增，在細(xì)胞回輸時(shí)發(fā)生感染。

    同時(shí)處于免疫抑制或免疫低下?tīng)顟B(tài)的患者，體內(nèi)潛伏的病毒也會(huì)進(jìn)一步活化，導(dǎo)致感染的發(fā)生。未知或罕見(jiàn)病原體的污染如豬來(lái)源的干細(xì)胞逆轉(zhuǎn)錄病毒的攜帶等。細(xì)胞自身所攜帶遺傳性疾病某些特殊的染色體隱性遺傳病的供體，由于其自身缺乏可供檢測(cè)的表型，可能會(huì)造成受體引入遺傳性疾病的風(fēng)險(xiǎn)。外源性污染，外源性污染的來(lái)源外源性污染，通常是指外源性微生物污染，包括細(xì)菌、支原體、真菌和病毒污染等。